این شاخه بر تشخیص بیماریها در جنینها، نوزادان و کودکان تمرکز دارد. پاتولوژیستهای اطفال و دوران جنینی با بیماریهای متنوعی از جمله ناهنجاریهای مادرزادی، اختلالات ژنتیکی، سرطانهای کودکان و عوارض مربوط به بارداری یا تولد سروکار دارند. آنها همچنین کالبدشکافیهای مربوط به مرگهای بیدلیل در نوزادان و مرگومیرهای پیش از تولد را انجام میدهند تا علل این موارد را کشف کنند و به بهبود مراقبتهای مربوط به بارداریهای بعدی و درمانهای اطفال کمک کنند.