این حوزه تخصصی بر تشخیص بیماریهای دستگاه گوارش تمرکز دارد که شامل مری، معده، رودهها، کبد، پانکراس و کیسه صفرا میشود. پاتولوژیستها با بررسی نمونههای بیوپسی از روشهای اندوسکوپی و نمونههای جراحی، بیماریهایی مانند بیماری التهابی روده (IBD)، بیماری سلیاک، سیروز کبدی، پانکراتیت و سرطانهایی مانند سرطان کولورکتال و سرطان پانکراس را تشخیص میدهند. تشخیص دقیق در این زمینه برای هدایت برنامههای درمانی، بهویژه در موارد سرطان، بسیار مهم است.